Должно ли юр. лицо всегда выступать налоговым агентом по НДФЛ для физ. лица?

Вы правильно решили, что они ошибаются, если только Вы им что-то из своего имущества не продали. Только в этом случае, организация не является налоговым агентом. У Вас же, как я понимаю, оплата за выполненную работу? Скорее всего организация уходит от страховых взносов, а на НДФЛ ей глубоко все равно. Поэтому со стороны организации неудержание НДФЛ по гр-прав. договору с физлицом на оказание услуг последним, конечно, нарушение, подпадающее по 123 ст. НК РФ. Жалко, что цитата ст. 226 НК РФ не включила п. 6 ст. 226 - при невозможности удержания НДФЛ (а такая возм-ть в данном случае у организации есть - выплата производится Вам в денежной форме?), такой налоговый агент обязан втечение 1 месяца по окончании года (т.е. до 1 февраля) сообщить об этом Вам и в свою налоговую. С тем, чтобы Вы своевременно подали декларацию и заявили такой доход, с которого не позднее 15 июля Вам надо будет уплатить НДФЛ. Имея ИНН КПП и название организации, Вы вправе сами сообщить о полученном доходе в 3-НФДЛ. Далее на усмотрение налоговой - можно ли срубить легкие деньги по ст. 123 НК РФ.